La decisión de Shinji había sido que los humanos fueran uno para no hacerse daño entre si, pero algo sucedió mal y la decisión de Shinji no se llevo a cabo, todo lo contrario. Se despertó y vio que estaba en el Apartamento de Misato, su mente estaba casi en blanco, no recordaba nada por el momento, no recordaba nada de los Ángeles, nada de NERV, nada de nada. Salió de la habitación a la cual estaba confinado para buscar a Misato, pero no la encontraba por ningún lado, poco a poco fue recordando todo, y todo tenían una imagen tan nítida que sería imposible olvidarla, se veía a él piloteando algo que sus recuerdos llamaban Eva, se veía luchando contra Ángeles, se veía junto a Rei, Asuka, Misato, Ritsuko y su padre Gendoh, se veía en su última batalla contra el 18vo Ángel, poco a poco lo recordaba todo. Fue a buscar su ID Card para lograr acceso a NERV, pero no la encontraba por ningún lado, era como si el ni existiera y fuera parte de un sueño que ha tenido, como si sus amigos, si los Evas, si todo, hubiese sido un sueño, era extremadamente raro, pero era posible, claro que era posible, sí había tantos tipos de Ángeles quizá alguno le había hecho esto, él no lo sabía con claridad, pero se daba cuento de que algo andaba mal. De pronto alguien abre la puerta del Departamento, es Misato, entonces Shinji sale corriendo en su búsqueda, pero Misato le empieza a pegar, diciéndole que no conoce a nadie llamado Shinji, y obligándolo a salir de allí. Luego de varios minutos de pelea logra calmarla, y le cuenta la situación. De pronto, se fija en el Calendario de la Heladera, la Fecha marcaba el día exacto en el que él se había convertido en el Piloto del Eva01, ese era el principio del fin.