Space Years 50, a humanidade evoluiu, mas também se dividiu. Uma parte permaneceu no planeta terra, enquanto outros três decidiram seguir seus próprios caminhos em busca de evolução tecnológica.

Mesmo com a evolução, os costumes de guerrilhar ainda se mostram ativos. O governo solar ataca as três maiores potências da via láctea: Vênus, Terra e Júpiter, objetivando uma conquista territorial e econômica sobre os seus inimigos.

A humanidade se uniu novamente, depois de quase cinco décadas após o começo da Space Years. A aliança dos três planetas decide contra-atacar com o seu próprio projeto militar: Project CODE.

Gundams, as armas da esperança para a humanidade lutar contra a própria humanidade em si. Como sempre, a guerra se repete.