Il était une fois, dans un univers proche du nôtre, deux villes voisines protégées chacune par un groupe de super-héros. L'équipe « Big Hero 6 », composée de quatre étudiants, un robot et un jeune garçon, veillait sur Sanfransokyo. L'équipe « Les Indestructibles », une famille de cinq personnes, veillait sur Newisko. Un jour, un terrible homme se faisant appeler Toolshed mit au point une technologie puissante qui lui permettait d'avoir un contrôle mental sur tous les outils à sa portée. Dévoré par la cupidité et la soif de pouvoir, Toolshed se mit à fabriquer des robots conquérants fonctionnant à l'aide d'outils tous plus destructeurs les uns que les autres. Les deux villes, menacées de sombrer dans la destruction, mais également dans esclavage humain par les machines, furent sauvées par leurs protecteurs respectifs qui avaient travaillé ensemble. Mais les choses se compliquèrent car aucune des deux équipes n'était d'accord en ce qui concernait le sort de Toolshed. Alors que le chef des Indestructibles voulait le faire envoyer dans une immense Île-prison aux conditions de vie si épouvantables que la plupart des détenus y périssaient ou devenaient fous, celui de Big Hero 6, bien moins radical, ne souhaitait que le livrer à la police de Sanfransokyo qui l'emmènerait sûrement dans une prison où la vie était, certes désagréable, mais correcte. Pensant que les criminels ne méritaient pas ce genre de prison, le chef des Indestructibles entra dans une colère noire contre le chef de Big Hero 6. Alors qu'il était captif, Toolshed profita de l'agitation pour s'échapper. Les deux équipes tentèrent de le capturer à nouveau mais l'un des membres de Big Hero 6 le tua sans le vouloir. Bien que les gens surent que la mort de Toolshed était accidentelle, certains accusèrent les super-héros d'être des assassins et non pas «les protecteurs qu'ils prétendaient être.» D'autres, Sanfransokiens et Newiskiens, s'accusaient mutuellement d'avoir des «pseudo-super-héros dangereux et stupides». Ces tensions déclenchèrent de nombreuses bagarres de rues toutes aussi violentes et dangereuses les unes que les autres. Voyant ceci, les chefs gouvernementaux des deux villes prirent la décision de fermer la frontière entre Sanfransokyo et Newisko. Ainsi, les habitants des deux villes ne se feraient plus de guerre civile inutile. Enfin, exceptés ceux qui trompaient la vigilance des gardes «protégeant» la limite séparant les deux villes. En ce qui concernait les équipes Big Hero 6 et Les Indestructibles, contrairement à ce que beaucoup croyaient, elles ne furent pas interdites d'exercer. Toutefois, elles furent interdites de collaboration sous peine d'être démasquées en public et envoyées en prison. Ainsi, bien que toujours capables de protéger leurs villes respectives, Big Hero 6 et Les Industribles virent leurs images ternies par cette triste histoire. Même si les deux équipes étaient majoritairement défendues par leurs villes respectives, nombreux étaient ceux qui disaient «Je hais Big Hero 6 et Les Indestructibles! Sans eux, on aurait pas ces problèmes!» qu'ils soient Sanfransokiens ou Newiskiens. Au fil du temps, tout espoir de réconciliation et de paix civiles disparut. Mais les choses pouvaient réellement rester inchangées ?