Tous les membres de l'organisation ont été tués, sauf un. Échappé de prison, il fera tout son possible pour trouver et se venger de la personne qui croie qui a tué ses collègues: Conan Edogawa alias Shinichi Kudo. Le détective n'a pas de temps à perdre. Il doit trouver le dernier membre de l'organisation avant que celui-ci décide de s'en prendre à ceux qu'il aime.