Kaito se vera envuelto con la Organización de Negro, después de que estos pusieran su vida en peligro, ahora, como un niño, se vera obligado a ayudar a Shinichi a vencerla y al mismo tiempo, seguir buscando la joya Pandora. ¿Que secretos saldrán a la luz?

Conan se ve obligado a hacerse pasar por el hijo de Vermouth y con esto quedará en la mira de muchas personas. ¿Podrá destruir la organización estando en una posición peligrosa? Pero los planes de Vermouth no ocurren como ella espera, un accidente retrasa sus planes y pone la vida de Conan en peligro.

One day Conan states a true fact but Haibara can't accept it. The next day Haibara calls Conan to tell him that she isn't making the antidote no more. When he tries to ask her why she doesn't answer which frustrates him. One he finds outit's because she wants to live as a normal child and making the antidote will interfere with her "childness". Warning this is not Coai