Chell es arrastrada nuevamente a los laboratorios de Aperture science, para enfrentarse a un emnemigo capaz de intimidar y asustar a la antes imponente GlaDOS. La IA y la humana deberan unir fuerzas para hacer frente a un nuevo rival, en un viaje donde tanto la maquina como la humana formaran un vinculo y haran frente a un olvidado pasado. (Uso de personaje propio)

Eggman gobierna el 99.99% del mundo gracias a Infinite, Sonic ha desaparecido y la esperanza con él. Solo que esto cambiara cuando un desconocido se une a la resistencia y se obtienen noticias de Sonic. Pero ¿será suficiente para ganar la guerra?