Han pasado 2 años desde que Ben Tennyson salvó el Universo de su fatal destrucción, y con su victoria celebrada en la Tierra, Ben, Rook, Gwen Kevin, se fueron de viaje por todo el Universo.
Ben ya tiene 18 años, y eso significa que ya tiene la edad para obtener el Control Maestro del Omnitrix, cuando Azmuth, se lo de, pero antes de que eso suceda, nuevas aventuras se avecinan para nuestro héroe, así también, el regreso de los villanos más malos como Vilgax.
Pero lo que nadie se esperaba, es que nuestros héroes, no están solos, de hecho, estarán acompañados, por un pequeño y valiente niño mago de 6 años.
Su nombre es... Peter.