La passerelle du Genesis était en ébullition depuis la reprise de la citadelle de Sarapin, l'amiral Bonnerille était en train de terminer de rappeler ses dernières troupes, maintenant que des forces de maintient de la paix étaient arrivées de Coruscant. La seconde nouvelle qui avait fait bondir de joie l'équipage était celle de la mort du général Grievous lors de la bataille d'Utapau. La guerre était terminée, il ne restait plus qu'a chasser les derniers membres du conseil séparatiste. Bonnerille finit par venir s'adresser à Amy.
« Vous voyez, le danger que vous redoutiez dans les implants des clones n'a pas influé la fin de la guerre. » Dit l'amiral, légèrement moqueur. « On dirais bien en effet, mais je reste persuadée qu'elles ont une utilité. » L'amiral la regarda, plus sérieux. « En effet, on a observé presque aucun épisode psychotique suite au retrait des implants. Au début je remettais en cause l'utilité de vos recherches… Maintenant c'est celles des implants que je remets en cause. » Un des clones des transmissions arriva pour les interrompre. « Mon amiral, transmission en arrivée de Coruscant, elle est universelle sur tous les holocoms et les transmetteurs des clones. » L'amiral arqua un sourcil légèrement étonné mais ce fut Amy qui réagit. « Etrange… »
Sur l'holocom central de la passerelle, un grand homme habillé d'une très longue cape noire à capuche dont les rares trais visibles étaient rongés par le côté obscur, et des yeux aux pupilles jaunes, apparu. Il commença à parler d'une voix caverneuse et forte. « Le moment que nous attendions est venu. Exécutez l'ordre soixante-six. » Il disparu aussitôt, Amy regarda partout autour d'elle prenant son sabre laser en main. « L'ordre… Non ! Ils n'ont pas osé ! » L'amiral regarda Amy tout aussi décontenancé. « Il faudrait croire que si… »
Beaucoup de clones de la passerelle ayant été traités, ils se regardèrent avec incompréhension. Cet ordre de la république qui existait depuis que celle-ci s'est fortement associé avec l'ordre Jedi, venait de retentir. Il était le sauf conduit conçu pour empêcher toute prise de pouvoir par l'ordre Jedi. Hélas certains clones n'étant pas traités, ils levèrent tous leurs armes vers Amy et Danny qui était un peu plus loin avant de commencer à ouvrir le feu.
L'humaine n'avait rien perdu de ses réflexes, elle para les tirs lui étant adressés à l'aide de sa lame pourpre. A côté d'elle l'amiral beuglait des ordres : « Cessez le feu ! Cessez le feu ! » sans succès. Ce fut les clones loyaux à Amy et Danny qui maitrisèrent leurs frères endoctrinés, hélas cela se finit par la mort de plus de la moitié des clones endoctrinés et d'une bonne partie des loyalistes. Au sortir de cette brève mais intense bataille sur le pont du Genesis, Bonnerille pris l'intercom de la flotte et hurla l'ordre suivant : « A toute la flotte ! Passage en hyperespace ! »
Les vaisseaux commencèrent à partir un à un. Puis Amy trouva Danny qui avait été blessé au cours de l'échauffourée, elle ordonna que le vaisseau soit sécurisé rapidement pour qu'il soit conduit à l'infirmerie. Bonnerille donna son accord et le capitale Miller des ARC qui avait été traité, tout comme son escouade principale se rangea aux côtés de l'ex maitre Jedi pour partir nettoyer le vaisseau des clones endoctrinés. Le commandant Reyes qui était à bord d'un des Venator d'escorte, ordonna d'abattre tous les clones endoctrinés qui refuseraient de coopérer.
Le nettoyage du Genesis dura bien quelques heures. Les vaisseaux étaient sortis d'hyperespace depuis un moment quand ils eurent fini. Danny put être conduit à l'infirmerie afin de recevoir des soins. Mais ils n'étaient pas au bout de leur peines : même si les Venators avaient put être nettoyés, le chevalier Trenran n'avait pas eu autant de chance qu'Amy et Danny. Il était sur la passerelle du second Venator d'escorte quand l'ordre soixante-six a été donné et il fut abattu par les clones avant que l'escouade Tesh ne puisse intervenir. Du côté des quatre Acclamators d'escorte, le bilant ne fut pas aussi glorieux que sur les navires de commandement qui contenaient le plus grand nombre de clones traités, l'un des vaisseaux se mit en formation avec la flotte alors que les trois autres se mirent en position d'attaque et commencèrent à bombarder le vaisseau amiral.
« Il ne manquait plus que ça ! Reyes ! Au rapport ! » Le commandant clone qui était remonté sur le Genesis entre temps, s'approcha de l'amiral. « Nos équipes de nettoyage se sont faites massacrer sur ces navires. Le rapport vient de tomber. » L'amiral regarda le clone, ainsi que Miller et May qui étaient présents. « Alors on n'a pas le choix… Je suis désolé. » L'amiral se tourna vers les timoniers et canonniers de son navire. « En position d'attaque, ordre à toute la flotte : abattez ces navires mutins. »
Les clones se sentirent mal à l'idée de tirer sur leurs propres frères, mais ils comprirent rapidement que c'était le seul moyen pour eux de rester en vie. Une pluie de tirs partit des navires toujours fidèles à l'amiral et percutèrent les trois mutins. L'armement avancé des Destroyers ne mis pas longtemps à avoir raisons des appareils de tonnage plus petit, les Acclamators furent vite réduits en cendres, mais le mal était fait. Les clones se sentaient mal, que ce sois à cause de cet ordre qui venait du cabinet du Chancelier Suprême ou du fait d'avoir dû abattre leurs propres frères qui ne voulaient pas entendre raison.
« L'ordre soixante-six… Un ordre que je n'aurais jamais cru entendre de mon vivant… » Déclara Bonnerille. « Il n'a été prononcé qu'une fois dans toute l'histoire de la République… » Déclara Amy, l'amiral et les deux officiers clone la regardèrent. « Vous saviez qu'il existait ? » Demanda Reyes. « Oui, et je doute que les Jedi d'aujourd'hui connaissent encore son existence, ou alors uniquement dans les hautes instances. » Bonnerille continua. « Cet ordre a été créé en cas de tentative de putsch de la part des Jedis, à l'époque où la république possédait encore une armée d'engagés volontaires. Mais j'ignorais qu'il avait déjà été utilisé. » Amy repris. « Une fois par le Chancelier Suprême Madon, il considérait que de livrer les Jedi aux envahisseurs de l'époque était un moyen de les apaiser. Il fut aussi connu comme étant le Chancelier ayant utilisé les deux ordres les plus dangereux de la République. » Miller la regarda. « Comment ça ? » Amy continua. « Il a utilisé l'Ordre soixante-cinq pour renverser le Chancelier Saresh, et ensuite le soixante-six pour traquer les Jedis. Quoi qu'il en soit… Si c'était bien le Chancelier actuel qui a envoyé l'ordre, on doit à tout prix éviter Coruscant. » Ce fut Reyes qui fut surpris. « Et pourquoi ? » Elle le regarda, soupirante. « Car c'est un Sith qui nous est apparu… Et seuls les clones portant encore leurs puces ont répondu à l'ordre. »
Tout le monde sur la passerelle compris ce qu'il se passait d'un coup. Les puces étaient garantes de l'exécution de l'ordre soixante-six, les clones se rendirent compte qu'ils n'étaient qu'un atout dans le plan d'un seigneur noir qui comptait s'emparer de la galaxie et exterminer les Jedis. Bonnerille le vécu encore plus mal que les autres, il avait donné sa vie à la république, il combattait pour elle avec des milices privées avant que la guerre des clones n'éclate, l'amiral se retira dans ses quartiers. Amy de son côté avec Reyes et Miller, commencèrent à sonder l'holonet pour voir où ces attaques se sont produites et comment sauver des Jedis. Elle posa aussi une balise sur une fréquence que seule la corvette de Thalia pouvait repérer, dans l'espoir qu'elle et quelques-uns du temple aient survécu.