Previamente:Sonic se encontro con Trashy, protector de marble zone, con el cual se alia para derrotar a Robotnik, el cual huyo otra vez, y Sonic se dirige a derrotarlo una vez mas
Sonic ha tenido un largo viaje, fue por Spring Yard a derrotar al Doctor Robotnik, pero este huyo a un laberinto, el cual tenia mucha agua. Esta subia mientras Sonic tenia una batalla con Robotnik; Robotnik reforzo la seguridad de sus badniks en Starline Zone, pero aun asi fallo, y ahora Sonic esta en Scrap Brain, zona del Doctor Robotnik
-Aqui vamos- Suspira
-Esta vez te vencere, y te desmotrare por que no tienes que meterte con Sonic el erizo y South Island- Sonic corre adentro de Scrap Brain
Sonic pasa por el piso de metal, el cual tenia unos agujeros de donde salia una gran llama, la cual sonic evita, y cerca de ahi ve a un Caterkiller en el cual va a caer, pero este se da la vuelta, Sonic se asusta ya que casi se golpeaba con el, para luego destruir al robot, Sonic va corriendo rapidamente hacia unas plataformas giratorias en el aire, Sonic piensa.
"Que Sorpresa el cara de huevo tiene una base peligrosa"
Sonic llega hasta la cima, donde ve una plataforma roja en el suelo, Sonic sin tomar atencion la pisa y esta se abre rapidamente, Sonic salta solo para ser atacados por unos Bat Brain, Sonic los ataca, para luego caer en otra plataforma roja, la cual se vuelve a abrir rapidamente, haciendo que Sonic caiga desde una gran altura, mientras grita, al caer, llega a un sitio lleno de Bombs, Sonic corre rapidamente evitando que exploten, Sonic sale de lugar solo para ver una horda de Ball Hog, los cuales atacan a Sonic, este con los nervios los destruye, de donde salen muchos Flickies, Sonic llega al final donde esta el doctor Robotnik
-Sonic, como llegastes hasta aca, si mi base esta contra cualquier ser vivo que no sea yo- Robotnik se sorprende
-Facil, parece que gastaste mas en darme una trampa que en los badniks, ya rindente Robotnik ya perdistes-
-Yo no me rindo-
Robotnik pisa un interruptor, el cual estaba enfrente suyo, para que luego se abra una compuerta en el suelo y Sonic caía mientras Robotnik se rie, Robotnik va a caminando, hasta unas capsulas, donde dentro estaban las esmeraldas del caos, Robotnik se toca el bigote pensando que ya habia vencido a Sonic.
-Y Sonic decia que era un cuento para niños-