Au cours de ce qui semblait être une mission banale, nos héros sont amenés à devoir désactiver une Tour isolée au milieu de la mère numérique. Mais au moment de la désactivation, ils se retrouvent (sauf Aelita) propulsés dans un endroit entre réel et virtuel crée par XANA pour y enfermer normalement ses erreurs irrécupérables. Ils y découvrent quelqu'un enfermé dans cet espace depuis déjà des années, un homme répondant au prénom d'Heinrich. La situation semblait déspérée. Mais Aelita, qui'ils parvinrent à contacter, trouva un moyen de les faire tous revenir sur Lyoko en se servant d'un portail, qui avait remplacé le Supercalculateur dans cet espace. Une fois tous, y compris Jérémy, sur Lyoko, ils ne leur restait plus qu'à trouver une Tour activée, pour revenir dans le monde réel. Mais cette fois, XANA est apparut en personne pour arrêter nos héros ; Heinrich de se sacrifier en occupant XANA le plus longtemps possible, pour que les autres parviennent jusqu'à la Tour, au prix tout de même d'un beau combat. Mais Heinrich ne revint pas de son dernier voyage sur Lyoko, il réussit à enregistrer un message avant d'être dévirtualisé. Nos héros avaient encore une fois triomphés de XANA, mais ils avaient perdu quelqu'un qui aurait pu devenir un ami...