¡Aviso! Puede haber faltado ortografía. No me pertenece nada de Megaman. Les recomiendo jugar a Megaman Zero 2 y 3.
Introducción: Después de 1 año
Bueno, todo comienza después de que Zero dejará la Resistencia por un 1 año.
Zero camina en un desierto de restos. Camina como puede, empujando la arena con su pie desgastado. Escucha pasos, mira hacia atrás y hay tropas de Neo Arcadia. Zero se saca la capucha y se ve en su cara como lucho durante un año. Se da vuelta y dice "Ok... Voy a... atacarle". Zero desenvaina su Z-Sable, empieza a cortar uno, por uno. Cuando termina, dice "Ya no es divertido esto...". Entonces, sigue por el camino y se encuentra con un Golem. Pero, en vez de brazos, tenía unas armas que disparaban láseres. Zero esquiva los láseres y le da con el Z-Sable, en su punto débil. Después, Zero esquiva los láseres y le da con el Z-Sable, en su punto débil. Así en bucle hasta que Zero lo derrota. Zero se quedó cansado, pero él siguió el camino sin problemas hasta que aparece un robot escorpión. Zero le quedaban dos neuronas en su cabeza, así que, esquiva el ataque de él y le da con el Z-Sable. Repite el mismo truco una y otra vez hasta que es derrotado el robot escorpión. Zero no aguanta con sus dos neuronas y se desmaya. Lo encuentra Harpuia y decide traerlo a la Resistencia (Por una razón que no se entiende) .
Capítulo 1: Sin Elpizo.
Zero despierta en una cama, y mira que esta Cerveau y Ciel. Cerveau dice "Zero, ya despertaste. Mientras dormías, yo te arreglaba todo el cuerpo. No sé como llevabas las armas". Al escuchar esto, Ciel dijo "Me alegra volverte a verte a Zero ¿Te vas a unir a la Resistencia?". Zero respondió "Si, porque..." Ciel interrumpe a Zero diciendo "Bueno, entonces. Para ver las 4 misiones que tienes que hacer, habla conmigo".
Zero tuvo que hacer las 4 misiones él solo. Y una de esas misiones era de exploración en un lugar frío y había mucha nieve. En esta misión iba Ciel, otros 2 soldados y Zero.
Capítulo 2: Misión Desconocida
Cuando empezó la misión, estaba nevando. Ciel mira de lejos una nave espacial, pensó que estaría abandonado, así que, usa la opción que siempre toma: que Zero lo explore. Va Zero y se da cuenta de que algo lo llama desde adentro de la nave espacial. De repente, aparece Harpuia diciendo que se fuera la Resistencia de este lugar. Zero le dice a Ciel que se estaba a la base y cuando Harpuia escucha eso se va. Zero, sin pensarlo 2 veces, entra a la nave espacial.
Zero mata a todos los enemigos que se cruzan en su camino. Así hasta que llego a la sala principal de ese lugar y se escucha que Fefnir y Leviathan perdiendo la batalla contra algo. Zero decide entrar.